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答：对于问题中提到的设计合同约定的包税问题，计算非居民企业所得税时，应按照有关规定将不含税收入换算成含税收入。
问题十一：项目”和“项目所在地”如何界定？例如境外企业与境内集团总公司签订劳务合同，但实际劳务接受方为境内的多家子公司；这种情况会被认定为一个项目还是多个项目？该境外企业应当在各劳务接受方所在地分别进行税务登记还是在合同签署地进行税务登记？境外企业又该如何进行纳税申报，是否可在某地汇总纳税？
答：项目所在地就是劳务发生地。境外企业与境内集团总公司签订劳务合同，但实际劳务接受方为境内的多家子公司，这种情况会被认定为多个项目，在各项目发生地办理税务登记和税款申报纳税手续。
根据企业所得税法及其实施条例规定，非居民企业在中国境内取得劳务所得，以机构、场所所在地为纳税地点。非居民企业在中国境内设立两个或者两个以上机构、场所的，经各机构、场所所在地税务机关的共同上级税务机关审核批准，可以选择由其主要机构、场所汇总缴纳企业所得税。主要机构、场所，应当同时符合下列条件：（1）对其他各机构、场所的生产经营活动负有监督管理责任；（2）设有完整的账簿、凭证，能够准确反映各机构、场所的收入、成本、费用和盈亏情况。
非居民企业经批准汇总缴纳企业所得税后，需要增设、合并、迁移、关闭机构、场所或者停止机构、场所业务的，应当事先由负责汇总申报缴纳企业所得税的主要机构、场所向其所在地税务机关报告；需要变更汇总缴纳企业所得税的主要机构、场所的，依照前款规定办理。
问题十二：如果支付人被税务机关指定为扣缴义务人的话，是否还有代纳税人申请税收优惠的机会？还是只能按照税务机关出具的文件缴纳税款？
答：支付人被指定扣缴的情形下，不影响支付人代理纳税人按税法规定申请享受优惠待遇，如税收协定待遇。
问题十三：如果非居民企业向居民企业提供服务，且全部在境外提供，若扣缴义务人未履行扣缴义务，税务机关很难直接向非居民企业追征税款，在实际操作中是否会向境内的扣缴义务人来追讨税款？
答：根据《税收征管法》有关规定，扣缴义务人应扣未扣税款的，由税务机关向纳税人追缴税款，对扣缴义务人处应扣未扣税款50％以上三倍以下的罚款。
问题十四：非居民企业派其雇员至中国境内提供咨询劳务，如果我国与该非居民企业所属国间没有签订协定，该如何征税？要区分构成常设机构与否？是统一按25％的税率征税，还是按10％的税率征税？
答：与我国没有签订税收协定的国家和地区的企业派遣雇员到中国境内提供咨询劳务，通常构成企业所得税法意义上的机构、场所，应对归属于该机构、场所的所得缴纳企业所得税，适用25％的税率，不再区分是否构成常设机构。
问题十五：非居民企业派其雇员至中国境内提供咨询劳务，如果我国与该非居民企业所属国间没有签订协定，该如何征税？要区分构成常设机构与否？是统一按25％的税率征税，还是按10％的税率征税？
答：与我国没有签订税收协定的国家和地区的企业派遣雇员到中国境内提供咨询劳务，通常构成企业所得税法意义上的机构、场所，应对归属于该机构、场所的所得缴纳企业所得税，适用25％的税率，不再区分是否构成常设机构。
问题十六：非协定国居民企业在我国境内取得收入，其所得税纳税义务怎么判断？与是否到境内的天数有怎样的联系？
答：如非协定国企业来华提供劳务，应以其境内设立的机构场所为纳税人，不管其派员在华停留的天数。
问题十七：如果非居民企业在国内承包工程，合同的期限是三年，但实际在中国工作的时间只是三十天。在判断非居民企业在中国是否构成常设机构时，是看哪个时间，是合同期限还是实际在中国的天数？
答：按照有关规定，判断承包工程是不是构成常设机构，应按承包工程的持续时间进行认定，其中临时性或季节性停工不减少工程持续时间。