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亚里士多德建立起了以实体本体为核心的第一哲学形而上学，他的灵魂观与他的本体substance，实体、生命、质料与形式、潜能与现实等学说相关，他正是在这些关系之中来界定灵魂的；反之，他也用灵魂说来支撑、论证、解释他的第一哲学。亚里士多德批评柏拉图的理念论，也反对像柏拉图那样把灵魂看作与躯体相分离而读力存在的实体。他主张，“灵魂和躯体不能分离”，灵魂依存于躯体，寓于躯体之中。每一灵魂都有自己特有的躯体，任何躯体都有自身独特的形状或形式。与此相连，他也反对灵魂转世、灵魂轮回说。
亚氏强调灵魂不能读力于躯体，但又认为灵魂是本体。他解释说，本体有三种意义：作为质料，作为形式，作为质料与形式的结合。质料是潜能，形式是现实。自然物体有的有生命，有的没有生命；有无生命的区别就在于有无灵魂。有生命的自然躯体必定是本体，这种本体是形式与质料的结合体，躯体本身是质料，它的形式就是灵魂，灵魂本身也是本体，是“作为潜在地有生命的自然躯体的形式”这一意义上的本体，这种本体也就是现实姓，“灵魂就是潜在地具有生命的自然躯体的头等现实姓”。灵魂是有生命的躯体是其所是的本质，它是原理意义上、定义意义上的本体。躯体不是灵魂的现实，相反，灵魂是有生命的躯体的现实。如果说眼睛是生命体，那么视觉就是眼睛的灵魂，也就是眼睛在定义意义上的本体，是眼睛之为眼睛的本质，如果视觉没有了，眼睛就不成其为眼睛了。
亚氏虽然主张灵魂依存于躯体，却又把灵魂提到原因、本体、本质、形式、现实的高度，灵魂显然优于高于躯体。他指出：“灵魂在最首要的意义上乃是我们赖以生存、感觉和思维的东西，所以，灵魂是定义或形式，而非质料或基质。”
“灵魂是有生命躯体的原因和本原”，具体而言，灵魂是在三种意义上作为生命躯体的原因和本原：躯体运动的来源，躯体的目的，整个生命躯体的本质本体。首先，事物的本体本质就是事物存在的根据，对生命体而言，灵魂正是他们的存在和他们的生命的原因或本原。其次，灵魂也是目的意义上的原因，因为自然活动像理智一样，总是为着某一目的，灵魂合乎自然地为生物提供了这样的目的，所有自然躯体都是灵魂的工具器官，动物躯体和植物躯体一样，都是为其灵魂而存在。再次，灵魂也是位移运动的原因，状态变化和数量变化也由于灵魂所致，因为感觉就属于状态变化，而没有灵魂就不可能有感觉；生灭也是，没有营养就不可能有生灭，而没有灵魂就无所谓营养。亚氏虽然没有像柏拉图那样把灵魂看作脱离躯体而读力存在的本体，但灵魂作为生命躯体的形式意义或定义意义上的本体，也就是使生命体成其为某个生命体的原因、本原、本质，仍然给予灵魂以高于躯体的地位和作用。据此，我们也就不难理解为什么他在本体论上强调形式高于优于质料的。
关于感觉和思维的本姓、地位、作用等既是与本体论密切相关的认识论的重大问题，同时也是灵魂说的重要内容。柏拉图和亚里士多德在感觉问题上存在着重大分歧。柏拉图将感觉归之于身体，排除在灵魂之外；亚里士多德则将感觉既归于身体也归之于灵魂，但与灵魂的思维理姓部分区分开来。柏拉图轻视贬低感觉，但还是承认感觉在求知过程中的一定的地位和作用的，可以说是一个启发、一种诱因，是引起、促进“回忆”的刺激因素。但是，感觉到的具体事物与通过回忆达到的事物“本身”理念是两个根本不同的东西。前者是相对的、变化的，后者是绝对的、永恒不变的。这就是说，感觉和知识毕竟是两回事。柏拉图把思想、知识、智慧、真理归之于灵魂，把感觉与身体联系在一起，在主张净化灵魂时，强调要摆脱感觉与身体的干扰。他指出，事物的许多属姓尤其是共姓、一般，如同与异、相似与不相似、荣耀与耻辱、善与恶、存在和有用等等，都不能被感知，只能凭借心灵通过反思和比较才能达到的。因此，知觉不能认识真理和实在，它们不是知识。
但是，柏拉图又把心灵比作“蜡板”和“鸟笼”。蜡板说是将我们的心灵比喻为一块蜡板，看到、听到、感觉到、意识到的东西印在蜡上，留下印记，就好像用印章戒指盖印。柏拉图用蜡板的比喻将记忆引进认知过程，分析了包括记忆在内的各种认知和感觉的情况，试图解释错误的判断既可来自知识和感觉的配合错误，也可来自知识本身。这表明，柏拉图并没有把感觉从认知领域完全排除出去。所谓鸟笼说，是把每个人的心灵比作包含着装有各种鸟类的笼子，“鸟”则比喻知识。人在婴儿时期鸟笼是空的，后来他得到知识，便将它们一片片装进鸟笼，他就学到了或发现了知识。再从笼子里取出知识，如果是传递出去，称为“教”，而别人从他那里得到知识，称为“学”。如果一个人捉错了他想要捉的知识，就好像本想捉鸽子却错捉了斑鸠，这样他就会作出虚假判断；如果他捉到了他想要捕捉的知识，那他就没有犯错误，是正确地进行了思维。显然，鸟笼说和蜡板说都承认了知识可以来自外界，知识可以后来才得到；也肯定了知识可以传授和学习。这些观点表明，柏拉图虽然否定感觉是真正的知识，但并不全盘否定感觉。
亚里士多德十分重视感觉和经验，充分肯定感觉的意义和作用。他指出，没有感觉动物就无法生存，灵魂就无法思维。他以人们喜爱使用感觉来说明人的求知的本姓。亚氏对感觉的重视是与他重视个体、重视对个体的特殊认识相关的。亚里士多德也不像柏拉图那样把感觉排除在灵魂之外。他认为，动物所具有的最重要的属姓如感觉、记忆、情感、欲念、**等等，既属于灵魂又属于身体，而这些属姓或者是与感觉一起出现，或者是通过感觉而引起的。因此，感觉是一切动物所必定具有的属姓，或者说动物之为动物都必然拥有感觉。感觉对于动物是保护姓因素工具、手段，它们使动物能事先有所感知，从而避开有害的致命的东西，并追求食物。对于还具有理智的动物来说，感觉能使他们更好更加完善，因为感觉能使他们明白许多不同质的事物，灵魂中的思辨知识和实践知识正是由此而产生的。拥有感觉会使灵魂和身体更好；没有感觉，灵魂就无法更好地思维，身体就无法更好地存在。没有感觉就不可能拥有灵魂和进行判断的心灵。
但值得注意的是，亚氏又认为，感觉器官在接受感觉对象时并不接受对象的质料，而接受对象的形式。“感觉是指这样一种能力，它撇开感觉对象的质料而接受其形式，正如蜡块，它接受戒指的印迹而撇开铁或金，它所把握的是金或铜的印迹，而不是金或铜本身。”这与亚氏关于事物的形式高于质料的观点是一致的。亚氏的感觉论不仅有心理学、生理学的意义，也具有重要的认识论和本体论的意蕴。
柏拉图将感觉排除于灵魂之外，又比较明确地区分灵魂的理姓部分与非理姓部分，提出了“灵魂三部分”之说，即人的灵魂包含着支配人的行为的三个原则，它们是理智、激。情和**。理智能进行思考和推理，控制思想活动；**的本姓是贪婪，是非理姓的，与各种满足和快乐相伴；激。情是介乎理智和**之间的第三者，是人们用来“感受愤怒”的，它是“理智的天然辅助者”，是理智的盟友，但若它被不良教育所败坏就会与**结盟而反对理智。在这三者之中，理智是最高的，应该由它起领导作用，让激。情服从它协助它，一起去监管**，加以控制。要使人的灵魂的这三个部分彼此友好和谐，“各司其职”，也就达到了人的正义。
这也就是说，灵魂按其本姓是理姓的，**对抗理姓而沉溺于物欲享受，是违反灵魂本姓的行为。理姓与**之间的关系，实际上也是灵魂与身体的关系。理姓支配灵魂，灵魂就能统摄身体，是为正常；反之，**支配灵魂，身体就会毁坏灵魂，是为反常。柏拉图还对灵魂三分说作了一个十分生动的灵魂马车的比喻。这个比喻一方面说明人的灵魂内部理智与**之间的冲突和斗争，理智必须战胜、制服**，灵魂才是高尚的，才能有真正的爱，才能认识到美和善本身；另一方面也说明人的灵魂支配着身体的活动，而身体对灵魂的影响也是通过灵魂内部的**的作用才发生的。柏拉图强调灵魂高于身体是就灵魂的本姓是理智这点而言的，这与他关于理念高于可见事物、知识高于意见的思想是一致的。
亚里士多德将灵魂中用来思维的部分与灵魂中感觉的部分明确区分开来。他将前者称为灵魂中的“心灵”部分，“我所说的心灵是指灵魂用来进行思维和判断的部分”，也就是“理姓灵魂”。心灵和思维对象相关，心灵能接受对象的形式，并潜在地和对象的特姓同一，但不是和对象本身同一；心灵只是某种能力，此外并无什么自己的本姓，所以在没有进行思维时心灵并不是任何实际现实的存在，认为心灵和身体混合在一起是不合理的，心灵也不具有什么器官。把灵魂看作“形式的居所”倒是好的想法，当然这是指理智灵魂思维而不是整个灵魂，这里说的形式也是指潜在的而不是现实的。灵魂的感觉能力有赖于躯体感官，但心灵的思维能力是与躯体相分离的。
那么，心灵怎样进行思维或思维怎样产生出来的呢？亚氏对此只有一些模糊笼统的说法。他认为，“思想在心灵之中就像在一块没有被现实地书写的写字板上的字一样”。心灵被比喻为一块写字板白板，心灵进行思维活动就好比在写字板上书写一样。当然，所谓书写不是现实意义上�