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独立思考能力有三要素：第一是慧根，第二是自由支配大脑的能力，第三是思考方法。
慧根
慧根是佛教里的概念，这里借用一下。在这里，慧根是指酷爱思考的天性。这里说的“思考”，当然是指那种认真和深刻的思考，比如人生啦，宇宙啦，自然啦，社会啦，政治啦，经济啦等等，杨振宁说过，应该“经常思考最根本的问题”，才有望在科学上有所建树。杨振宁所说的最根本问题，就需要非常认真而深刻的思考。
而且这种对于认真而深刻思考的喜爱还得加上一个程度，就是酷爱，酷爱思考的人应该是什么样呢？他们是一群以思考为人生最大目的的人。如果不能自由思考，他们简直会痛不欲生。亚里士多德说过，人生的最终目的不是生存，而在于思考和觉悟的程度。王小波可谓这句话的身体力行者，他在《思维的乐趣》一文里写到：
插队的生活是艰苦的，吃不饱，水土不服，很多人得了病，但是最大的痛苦是没有书看，倘若可看的书很多的话，《变形记》也不会这样悲惨地消失了。除此之外，还得不到思想的乐趣。我相信这不是我一个人的经历：傍晚时分，你坐在屋檐下，看着天慢慢地黑下去，心里寂寞而凄凉，感到自己的生命被剥夺了。当时我是个年轻人，但我害怕这样生活下去，衰老下去。在我看来，这是比死亡更可怕的事。
我认为自己体验到最大快乐的时期是初进大学时，因为科学对我来说是新奇的，而且它总是逻辑完备，无懈可击，这是这个平凡的尘世上罕见的东西。与此同时，也得以了解先辈科学家的杰出智力。这就如和一位高明的棋手下棋，虽然自己总被击败，但也有机会领略妙招。在我的同学里，凡和我同等年龄、有同等经历的人，也和我有同样的体验。某些单调机械的行为，比如吃、排泄、性交，也能带来快感，但因为过于简单，不能和这样的快乐相比。
对于一个爱思考的人来说，一件“比死亡更可怕的事”就是，没有提供“思想乐趣”的书来读。
正因为有慧根的人酷爱思考，也就是爱动脑筋，所以他绝对不会认为思考是一件苦差事，是一件很艰难的事情。相反，如果有谁限制了他的思考活动，那就是剥夺了他人生最大的快乐，你说他能不痛苦吗？
为什么这种人天生就酷爱思考呢？这应该跟基因有关，跟性格、大脑构造有关。这种人，除了睡觉之外，他们的大脑就像永动机一样，会一刻不停的运转。
经济学家凯恩斯有一句名言，“杰文斯看到壶开了，高兴得像个孩子似地叫了起来；马歇尔也看见壶开了，却悄悄地坐下来造了一部蒸汽机。”这句话里提到的马歇尔便是一个有慧根的人，旁人认为司空见惯的事物，他却认为这里面有值得思考的内容。
再如牛顿15岁的时候从中学退学，只好回家种田，成了一名地道的农夫。但是，这个农夫跟通常的农夫是不一样的。人们经常看到他在田野里呆呆地站着，若有所思，或埋头在小本上急速地写什么。发呆是有慧根的一个标志。发呆的原因就是这个人的大脑始终在不停地转动，不停地思考。如果哪位家长看到自己的孩子特别喜欢发呆，不喜欢琐事，那么祝贺你，你的孩子极有可能是一个有慧根的人。
又如爱迪生从小体弱，看起来并不聪明。可是他是一个有慧根的人，脑子在不停的运转。比如他看到母鸡会孵出小鸡，就问：为什么母鸡能孵出小鸡而人不能呢？看到老师在黑板上写下“2＋2=4”，他就问：“2加2为什么等于4？”
在现实生活中，有慧根的人数量是极为稀少的，根据我对周围人的观察，数量应该在千分之一以下。也就是说，有慧根的人可以说是千里挑一。
大多数人虽然从大脑机能上讲有能力去思考复杂、抽象、深刻的问题，但是他们的遗传基因里并没有爱思考这样的密码，所以他们根本就不会爱上思考，反而会认为思考是件苦差事。
有慧根的人在人类历史的长河中是很受歧视的。在农业社会里，他们往往会被视作懒惰、无用、不务正业。而在宗教社会里，他们往往被看作异端、怪物，甚至被烧死。有慧根的人真正扬眉吐气是在知识社会里。这种社会主要靠大脑而不是双手来创造财富，所以他们得到了空前的重视。现在，各个国家都在嚷嚷着培养有独立思考能力的学生。我们国家也开始大力推进素质教育。
慧商何来（2）
没有慧根的人不会把思考当成乐趣，对他们来说，思考不仅不是乐趣，而且是一种极其惹人厌恶的体力活。所幸，他们可以找到工具来代替他们思考，比如书本，老师等等，他们只需把现成的知识记住即可。
这类人虽然并不“酷爱思考”，但也具有一定的思考能力。只是他们进行的思考往往随便和粗浅而已。比如想到哪个商店能买到便宜货啦，怎么拿高分啦，怎么跟上司处好关系啦
等等。除非有外力强迫或者利益诱惑，他们不会进行深刻、复杂的思考。所以这类学生对那些超出考试范围的知识、事物，根本提不起兴趣去思考。我在北大读书的时候便见到很多这样的人，你要跟他谈考试范围里的事情，他简直聪明绝顶，可遇到考试范围之外的知识，他无知得就像婴儿。
“慧根”这玩意儿到底能不能培养呢？能不能通过教育、引导，让一个天生没有慧根的人爱上思考呢？我觉得这是一件极为困难的事情。就如让一个爱思考的人爱上逛服装店那样艰难。
有一种促进思考的方法是，给一个不爱思考的人巨大的物质诱惑。其实现在的高考就是这样的，有的老师讲，“书中自有黄金屋，书中自有颜如玉”，这就是巨大的诱惑，可以让很多人被迫开动脑筋去思考。但是，高考一结束，这些人的懒惰又开始了。所以归根结底，他们会成为好下属、螺丝钉，他们也能在呆板的考试中出类拔萃，但是，你永远不要指望他们会有创造力，会成为思想家、艺术家和发明家。
所以我们现在可以弄明白这个事实，就是我们通常所说的智力上的天才（除体育、音乐、表演等），其实跟智商的关系不大，主要是要有这种“慧根”。有“慧根”是成为天才的基础。我们知道，很多按照智商选拔学生的大学少年班都以失败告终，很多智商很高的神童最终都泯然众人矣，为什么呢？原因在于他们没有弄明白：天才是要有慧根的。
自由支配大脑的能力
一个人有了“慧根”，并非意味着他就具有了独立思考的能力。某种意义上说，“慧根”为独立思考提供了动力，而且是效能极大的核动力。不过，正如一个武功高强的人被捆住了手脚也难有作为一样，人的大脑要进行独立思考必须得有可供独立思考的时间和空间。这可以说是独立思考的外部环境。
很多人的可悲之处，便是即使有“慧根”，有思考生命、宇宙与社会的强烈愿望，却由于功课繁忙，工作繁忙，或者环境所迫，根本无暇去独立思考。因为对于他们来说，生存是第一位的，为了生存，思考的乐趣往往会被牺牲掉。
比如为了生存，王小波只好去下乡插队，去忍受无书可读，无法享受思考乐趣的痛苦。而众多有慧根的学生为了读大学，被迫坐在课堂上听老师乏味的讲课。如果一个人的大脑根本就不能供自己自由支配，他也就根本无从独立思考。
我写过一篇《大脑争夺战》的文章，说的就是这种悲惨的景况。
从我学会发呆想事起，我的大脑就被人接管了。记得我读小学的时候，最快乐的一件事就是写作文，因为只有这个时候，我才稍稍可以让自己的大脑自由活动一下。而剩下的时间，就是做无聊的算术题并对一些垃圾文章做无穷无尽的结构分析。六年级的时候，我实在抑制不住发狂的想像，便在上课的时候，偷偷写一些武侠、流浪题材的小说。
进了中学，小学时写的什么武侠小说，流浪汉小说统统收藏起来，开始研究议论文的模板以及高分秘诀。我知道这个时候，我的脑袋已经被冥冥中的某个阅卷老师接管。然后，物理化学这样的洪水猛兽来了，我清楚记得化学老师对我的央求，“你及格一次吧”。可是，对我这样一个铁了心要当作家的人来说，那堆化学符号百分之百属于浪费时间。我也记得物理老师对我的威胁，“你再不做作业，肯定考不上大学”。好在后来分了文理班，老师与我落了个皆大欢喜。
大学跟中学并无本质区别，一群乏味的老师讲一些乏味的课程，而且对点名乐此不疲。课堂之外，又是没完没了的英语，考级等等。留给自己发呆的时间实在有限。我清楚记得有一门世界上最尖端的学问叫“汉语音韵学”，这门课世界上只有不超过20人在研究，倒霉的是，我们系就有这样一位德高望众的前辈，连系主任都让他三分。所以他的课年年是必修。我在他的课上补足了所有午觉，而他，则不动声色的在我的分数上渲泄一把。
终于工作了。我的第一个工作是一家地方电视台，在这里，我的大脑又被台里、市里的领导们接管，每天写一些诸如“市委X书记指出”这样狗屁不通的文字。采访完毕，像猪一样的被赶上餐桌，喝得有些酩酊之后，又像猪一样被拉进卡拉OK厅，跟着一群乱七八糟的人一起哼哼……
后来回到北京，为各种背景的电视机构服务，此时，脑袋又被老板以及各个有审片资格的领导接管。每天写的东西，经常让我有呕吐的冲动。
说起来很可悲，我竟然为这样一个简单的、能够尽情地发呆、尽兴地胡思乱想、自己支配自己大脑的自由奋斗了好多年。而更可悲的是，在今后的岁月里，我的大脑注定还会经常为别人所支配